Computational Modeling of Protein-Ligand Interactions
The team’s work, prior to 2019, was carried out within the UMRS Paris Diderot-Inserm 973 (MTi)
Defended PhD Theses since 2012
2023
Mariem GHOULA – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 10/07/2023
Sujet : Analyse Bioinformatique de protéines thérapeutiques: étude des protéines partenaires du Facteur de Préimplantation (PIF) et des protéines du SARS-CoV-2.
Sarah NACERI – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 02/06/2023
Sujet : Exploration structurale des protéines pour leur validation en tant que cibles thérapeutiques.
2022
Bryan DAFNIET – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 15/12/2022
Sujet : Identification des interactions médicamenteuses délétères et des variations génomiques structurales entraînant des effets secondaires chez l’homme à l’aide d’outils d’apprentissage automatique.
Emilie GUILLOCHON – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 9/11/2022
Sujet : Étude du transcriptome de Plasmodium falciparum dans un contexte de paludisme cérébral.
2021
Pierre LAVILLE
Soutenance le 15/10/2021
Sujet : Étude des mécanismes de résistance du VIH-2 pour les inhibiteurs de protéase en utilisant des approches de bioinformatique structurale.
2019
Natacha CERISIER
Soutenance le 24/09/2019
Sujet : Modélisation des interactions protéines-effecteurs et développement de méthodes de prédiction de ces interactions.
2018
Dhoha TRIKI
Soutenance le 6/04/2018
Sujet : Étude des mécanismes de résistance naturelle de la protéase de VIH-2 (PR2) contre les inhibiteurs de protéase par des approches de bioinformatique structurale pour la recherche d’inhibiteurs ciblés de PR2
Ikram ALLAM
Soutenance 01/2018
Sujet : Développement d’un alphabet structural protéique adapté aux problématiques du Drug Design et à la recherche des motifs fonctionnels
2017
Grace SHEMA NZABONIMPA
Soutenance le 20/12/2017
Sujet : Pharmacogenomics and personalized medicine in the treatment of ADHD
Stéphanie EUSTACHE
Soutenance le 01/02/2017
Sujet : Étude de la protéine ribosomale el42 : analyse fonctionnelle de mutations, méthylations et interactions avec des ligands.
2016
Carlyl RIBEIRO LIMA
Soutenance le 16/12/2016
Sujet: Structural modeling and characterization of target specifics of Trypanosoma cruzi, etiologic agent of Chagas disease.
Ines RASOLOHERY
Soutenance le 22/11/2016
Sujet: Développement d’une méthode pour la détection de cibles secondaires de ligands.
Lydia BENKAIDALI
Soutenance le 15/09/2016
Sujet : Étude et applications de nouveaux modèles géométriques des canaux d’accès au site actif de certains cytochromes P450 humains par des ligands volumineux.
Hiba Abi HUSSEIN
Soutenance 23/06/2016
Sujet : Chemogenomique Structurale : analyse des poches protéiques et de leur capacité à fixer des ligands, prédiction de leurs partenaires ligands potentiels
Alexandre BORREL
Soutenance 05/2016
Sujet : Modélisation des poches protéiques, de leur druggabilité et prédiction des profils de ligands associés
2015
Jens Nielsen KRINGELUM
Soutenance 12/2015
Sujet : Target Profiling of Drugs
2014
Pierre THEVENET
Soutenance le 18/09/2014
Sujet: Exploration des interactions peptide-protéine
2012
Yimin SHEN
Soutenance le 26/09/2012
Sujet: Bioinformatique appliquée à la prédiction de structure des peptides.
